Peatoimetaja on ajakirjandusväljaande (ajalehe, ajakirja, tele- või raadiokanali) toimetuse, tõlkebüroo või kirjastuse juht.
Ajakirjanduses on peatoimetaja ülesanne suunata toimetuse sisulist tööd; ehkki organisatsiooni struktuuris võib olla ka temast kõrgemal seisvaid juhte, ei tohi need toimetuse ajakirjanduslikku töösse otseselt sekkuda.